IT时代网11月10日消息，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心团队建立了环形RNA单分子原位成像技术abcFISH，解决了环形RNA难以在细胞和组织中原位、定量成像的技术难题。

除反向剪接位点外，环形RNA在一级序列上与其同源的线形RNA一致，难以实现特异、灵敏的单分子成像。现有成像方法受到目标长度、检测成本及多色成像能力的限制，亟需建立灵敏、适用广且便于推广的多重成像方法。

abcFISH采用滚环扩增技术特异检测环形RNA的反向剪接位点，通过设计分别靶向反向剪接位点上下游的padlock探针与primer探针，仅在两探针相邻结合于反向剪接位点时触发连接与扩增，实现对环形RNA的高灵敏度、高信噪比检测。

该技术可规避与线性亲本转录本的交叉杂交，突破传统单分子荧光原位杂交对环形RNA长度与丰度的限制，同时支持多重检测，适用于细胞、小鼠组织及福尔马林固定石蜡包埋切片。借助它，研究人员可区分同一基因位点产生的不同环形RNA异构体，实现多种环形RNA的原位定量检测。

abcFISH为环形RNA研究提供了兼具单分子分辨率和空间信息的分析工具，有望助力环形RNA功能解析、疾病标志物探索及环形RNA药物评价等研究。相关成果在线发表于《自然-方法》（Nature Methods）。

注：本文配图由AI生成，文中包含AI辅助创作的内容。

编辑：刘宁