未来论坛 2026-11-02 23:12:23
一份血液样本能够透露多少关于年龄的信息?除了血细胞数量、血糖和胆固醇,DNA上细小的化学修饰,也会随着生命进程发生变化。将其中一些位置的变化组合起来,研究者可以估计样本提供者的年龄,进一步考察这种估计与疾病、死亡风险之间的关系。
Steve Horvath(史蒂夫·霍瓦特)让这条研究路径获得了广泛使用的工具。2013年,他发表了一套基于353个DNA甲基化位点的年龄预测模型。同一套算法可以用于多种人体组织,使研究者得以在不同器官和细胞之间,比较与年龄有关的分子变化。这项成果后来被称为Horvath时钟。
此后,Horvath与合作者不断调整测量的目标:从估计一个人经历了多少年,转向预测健康风险,再将研究扩展到寿命差异悬殊的哺乳动物。随着这些工具进入越来越多的实验,他也必须面对更深入的问题:一种能够准确预测年龄的分子信号,究竟解释了多少衰老本身?
Steve Horvath,加州大学洛杉矶分校人类遗传学与生物统计学教授
用数学寻找生命变化中的共同模式
Horvath的学术道路起步于数学。他在德国成长,1995年获得美国北卡罗来纳大学教堂山分校数学博士学位,随后转向生物统计学,于2000年获得哈佛大学科学博士学位,同年加入加州大学洛杉矶分校。
这段训练使他熟悉两类工作:用数学建立可以推演的关系,以及在复杂、带有噪声的生物数据中检验这些关系。生命科学实验往往同时测量成千上万个变量,研究者需要判断,哪些变化能够重复出现,哪些关联只是样本或分析方法造成的偶然结果。
在衰老时钟之前,Horvath已参与发展加权基因共表达网络分析。2005年,他与Bin Zhang发表相关方法框架;后来,他又与Peter Langfelder合作开发分析软件。它将表达变化相近的基因组织成不同模块,帮助研究者从大量测量中辨认共同变化的结构,并考察这些结构与疾病或生理特征的联系。
这种方法关注多个变量之间的关系。它也提供了一种处理复杂问题的思路:单个分子的变化可能很不稳定,许多分子共同呈现的模式,却可能包含可靠的信息。
年龄正是一个适合检验这种思路的问题。出生日期清楚地记录着时间,但同龄人的身体状态存在差异。研究者希望找到能够反映这些差异的生物标志物,又必须先回答一个基础问题:在组织类型、生活经历各不相同的样本中,能否识别出稳定的年龄信号?
2011年,Horvath参与的一项研究提供了早期证据。Sven Bocklandt、Eric Vilain等合作者分析唾液样本,发现特定DNA位置的甲基化水平与年龄密切相关,并据此建立预测模型。这项工作表明,年龄可以通过分子测量被估计出来。
Horvath随后进一步扩大问题的范围。血液、脑和皮肤承担着不同功能,具有各自的分子特征。如果每种组织都需要完全独立的模型,结果之间就难以比较。他希望找到一组跨越组织差异、仍然与年龄保持联系的变化。
让不同组织拥有可以比较的年龄读数
DNA甲基化通常指在特定DNA碱基上添加甲基。这种修饰不改变DNA序列,却与基因调控、细胞身份和发育过程有关。在常被研究的CpG位置,也就是胞嘧啶与鸟嘌呤相邻的位置,甲基化水平可以被实验技术测量。
这里的甲基化水平,通常表示样本中某个位置发生甲基化的比例。随着年龄增长,一些位置的比例上升,另一些下降。不同位置的变化方向和幅度各不相同,单独观察其中一个,很难完整描述年龄。
Horvath的工作是把这些变化组合成一个可以计算的模型。他利用公开数据,将一部分样本用于建立模型,再用独立样本检验预测效果。模型需要兼顾准确性与稳定性,避免把训练样本中的偶然特征误认为普遍规律。
2013年的研究覆盖51类人体组织和细胞,最终选出353个CpG位点,按不同权重整合其甲基化信息。在整体测试数据中,预测年龄与实际年龄高度相关,中位绝对误差为3.6年。不过,各组织的表现存在差别,这个总体结果不能被理解为每一份样本都具有相同精度。
Horvath于2013年发表的跨组织时钟研究图
跨组织模型的重要性在于,它为比较提供了共同标准。研究者可以进一步考察,某种疾病、遗传背景或生活暴露,是否与特定组织的甲基化年龄偏高有关,也可以追踪同一批人在不同时间点的变化。
但一个模型很会预测生日,并不保证它同样擅长判断健康状况。最初的Horvath时钟主要以实际年龄为学习目标。它捕捉到的信号中,可能既有发育和成熟留下的变化,也有与成年后健康风险相关的变化。要更接近后一个目标,模型的建立方式也需要改变。
2018年,Morgan E. Levine、Horvath及合作者发表PhenoAge,将临床指标所反映的健康差异纳入模型设计。2019年,Ake T. Lu、Horvath等人进一步开发GrimAge,利用DNA甲基化估计与吸烟经历及部分血浆蛋白有关的指标,再将这些信息与生存结局联系起来。
由此,研究目标逐渐转向识别同龄人之间的风险差异。一个甲基化年龄偏高的结果,只有在后续随访中持续关联疾病、功能下降或死亡风险,才具有更明确的健康意义。
这些模型也有各自的适用范围。GrimAge中的年份单位是一种统计表达,不能直接解释为某个人还剩多少年寿命。同一份样本在不同模型中得到不同结果,也可能源于模型学习的目标不同。Horvath与合作者推进的,正是一套需要结合研究目的选择和解释的测量方法。
跨越物种之后,继续检验时钟意味着什么
人体组织之间的共同变化,使Horvath进一步追问:人类与其他哺乳动物之间,是否也存在可比较的年龄信号?
这项工作面临直接的技术困难。物种之间的DNA序列存在差异,原本为人类设计的检测工具,无法简单用于所有动物。Horvath与国际合作者围绕进化上较为保守的DNA区域开发检测平台,并汇集来自不同物种、不同组织的样本。
2023年,团队发表泛哺乳动物时钟研究,分析覆盖185种哺乳动物、59类组织的超过一万份样本。模型能够在寿命和发育节奏差异很大的动物之间估计年龄,显示部分与年龄相关的甲基化变化跨越了漫长的进化距离。
这类研究依赖广泛合作。统计建模需要可靠的年龄记录,跨物种分析需要能够比较的检测位置,而样本收集则离不开研究不同动物的团队。Horvath所推动的共同模型,建立在这些分散而细致的工作之上。
跨物种结果为研究衰老提供了新的线索。2024年,他与合作者进一步发现,在某些与发育调控有关的基因组区域,甲基化变化速率与物种最大寿命存在特定关系。这种关系依赖所考察的区域及统计条件,提示发育、维持和衰老之间可能存在联系,也留下了需要实验检验的机制问题。
这些发现还不能证明,改变某几个甲基化位置,就能按比例延长寿命。一个指标可以记录生物过程,也可能参与其中;区分这两种情况,需要有针对性的干预和功能测量。
当表观遗传时钟被用于评价干预措施时,同样需要这样的区分。某项处理后,时钟读数下降,是值得继续研究的结果。它是否对应更好的组织功能、更少的疾病或更长的健康寿命,还需要对照实验和长期随访。血液中细胞组成的改变、检测误差和样本处理差异,也都可能影响读数。
因此,时钟能够帮助研究者筛选线索、比较实验,却仍需与身体功能和临床结局相互验证。Horvath工作的影响,既体现在这些工具被广泛采用,也体现在它们促使研究者更明确地定义:究竟要测量衰老的哪一部分,又需要怎样的证据证明干预有效。
2026年7月,Horvath回到加州大学洛杉矶分校,担任医学教授兼医学系衰老生物学研究主任。经历生物技术领域的研究工作后,他将继续与临床及基础研究团队合作,推动年龄测量与健康问题之间更紧密的联系。
Steve Horvath在昌平实验室作学术报告
2026年11月7日,Steve Horvath将出席2026未来科学大奖周科学峰会,于生命科学专场发表题为《表观遗传时钟揭示了哪些衰老规律?我们能否逆转衰老?》的主旨演讲。报告将结合时钟的发展与干预研究,讨论甲基化年龄能够说明什么,以及判断衰老是否被改变仍需哪些证据。
回看Horvath的研究道路,贯穿其中的是对可比较、可检验结果的持续追求。他把数学与生物统计学的训练带入衰老研究,从不同组织的数据中寻找共同变化,再邀请更广泛的合作来检验这些变化。由他和合作者建立的测量方法,让许多关于年龄的讨论有了具体的实验依据,也让新的发现能够接受更严格的追问。
Figure 2 | DNA methylation age of human tissues and cell types | Genome Biology | Springer Nature Link
A leader in the study of longevity is returning to UCLA Health | UCLA Health
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发布时间:2026-11-02 21:21:25
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