Nature子刊：从致病病毒到噬菌体，解开肠道PBV的身份谜团 | 热心肠日报

由于缺乏任何可用的细胞或动物模型，PBV的真实宿主一直饱受争论。虽然PBV基因组中存在的细菌核糖体结合位点（Shine-Dalgarno序列）强烈暗示了其原核起源，但科学家始终缺乏直接的培养证据。为了解决这个问题，研究团队另辟蹊径，将目光投向了无菌小鼠。

研究人员选取了两份含有不同PBV基因型（PBV-18941与PBV-19022）的人类粪便样本，通过粪菌移植的方式灌胃给无菌小鼠。结果显示，这两种PBV在小鼠肠道内均实现了千万倍增长，并成功定植超过23天。在随后的传代实验中，PBV-19022能够在所有接受移植的小鼠体内稳定且一致地扩增，充分证明了这种体内培养模型的可靠性。

为了锁定PBV-18941的真实宿主，研究团队在体外进行了混合菌群的厌氧培养。在排除了任何残余小鼠细胞的厌氧环境中，PBV-18941成功实现了连续20代的增殖。这本身就是一个关键信号，意味着它的宿主必须在细菌群落中被富集。

随后的抗生素筛选实验提供了更有力的证据。数据显示，在培养基中加入新霉素、万古霉素或甲硝唑时，PBV-18941的生长被彻底清除。这表明，PBV-18941的复制依赖于对这些抗生素敏感的细菌，而非能够耐受这些药物的哺乳动物细胞。这是指向其噬菌体身份的直接实验证据。

获取最终证据的手段是RNA荧光原位杂交（RNA FISH）。高分辨率图像清晰地显示，PBV-18941的两段RNA基因组片段只会在细菌细胞内部发生共定位，且受感染的细菌形态大多呈现特征性的双杆状。

为了揪出具体的宿主真身，研究团队利用流式细胞荧光分选技术，富集了那些携带高强度PBV信号的细菌。通过16S rRNA基因测序比对，一种此前未知的厌氧菌占据了主导地位。经过系统命名，该团队将其定义为“Candidatus Anaerotignum faecalis”（意为“粪居厌氧棍菌”）。进一步的感染动力学实验直接证实，这种细菌是PBV-18941攻击的靶标。值得注意的是，该细菌属于革兰氏阳性菌，这打破了此前所有已知RNA噬菌体仅感染革兰氏阴性菌的旧有认知。

这一发现迫使科学界必须重新审视PBV与人类疾病的关系。以往的假说认为PBV是直接导致腹泻或肠炎的病原体，但新证据表明，这种病毒实际上是通过感染肠道内的特定细菌来对人类宿主产生间接影响。

研究团队推测，PBV与多种疾病之间的统计关联，很可能源于它通过裂解细菌来调节肠道菌群的组成和代谢。任何关于PBV致病机制的后续研究，都必须将它的细菌宿主纳入核心实验框架。这一范式转变也为寻找新型噬菌体疗法提供了意想不到的备选对象。同时，该研究建立的体内外培养与宿主鉴定路线，也为解析人体肠道中其他成千上万种功能未知的噬菌体，提供了一套成熟而可复制的实验蓝图。