采收后要根据果实大小、外观品质进行挑选分级，按照等级大小分别放置。南瓜采摘后要在阴凉通风处分散摆放以散出田间热，对一些成熟度不是太高的南瓜，要在24-27℃的遮阴环境下1-2周，促进其果皮硬化直至完全成熟。贮藏的南瓜要求都是品质优秀，没有碰损，没有病虫害的老熟南瓜。
　　南瓜需要在阴凉、通风、洁净的仓库或地窖里贮藏。贮藏南瓜的最适温度在10℃。相对湿度应保持在70%-80%。贮藏后也要定期检查，及时发现捡出病果坏果，防止病害污染贮藏环境。常见的南瓜贮藏病害有疫病、镰刀菌果腐病、南瓜青霉病、白绢病和菌核病等。