相传在古代，有一位名叫“洪崖仙人”的道士在洪崖洞修道，因此这个天然形成的石洞被命名为“洪崖洞”。洪崖洞原名洪崖门，是古重庆城门之一，位于嘉陵江畔的陡峭山壁上。

洪崖洞的历史可以追溯到战国时期，当时这里是巴国的领地，秦国灭巴国后，洪崖洞成为了一个军事要塞。在南宋时期，洪崖洞是一座石窟寺庙，洪崖门原是一道开门，曾发生过一场惨烈战事。

明朝时期，洪崖洞已成为一个商业街区，是重庆最繁华的商业中心之一。清代时，洪崖洞已发展成为一个繁荣的码头，是重庆的贸易中心。

清雍正八年进士、乾隆年间巴县知县王尔鉴作《洪崖滴翠》，描述了洪崖洞的美景，这首诗也使得洪崖洞声名远扬。

2002年，洪崖洞景观工程开始竞标，2003年动工。2006年，总投资3.85亿元的洪崖洞景区建成，形成了11楼和1楼走出去都是马路的山城特色。

洪崖洞不仅是一个旅游景点，也是重庆历史文化的载体。它见证了重庆从古至今的变迁，从军事要塞到商业中心，再到现代的旅游胜地。